Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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NCF4Q15080 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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NCF4Q15080 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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NCF4Q15080 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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