Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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CHD4Q14839 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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CHD4Q14839 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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CHD4Q14839 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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CHD4Q14839 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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CHD4Q14839 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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CHD4Q14839 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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CHD4Q14839 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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CHD4Q14839 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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CHD4Q14839 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHD4Q14839 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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