Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
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