Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLAMF1Q13291 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms