Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
COX10Q12887 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COX10Q12887 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COX10Q12887 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COX10Q12887 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COX10Q12887 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COX10Q12887 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COX10Q12887 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COX10Q12887 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COX10Q12887 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COX10Q12887 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COX10Q12887 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COX10Q12887 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COX10Q12887 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COX10Q12887 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COX10Q12887 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COX10Q12887 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COX10Q12887 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
COX10Q12887 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COX10Q12887 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms