Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms