Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms