Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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UBXN7O94888 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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