Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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ARL2-SNX15V9GYD0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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ARL2-SNX15V9GYD0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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ARL2-SNX15V9GYD0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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ARL2-SNX15V9GYD0 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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ARL2-SNX15V9GYD0 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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ARL2-SNX15V9GYD0 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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ARL2-SNX15V9GYD0 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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ARL2-SNX15V9GYD0 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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ARL2-SNX15V9GYD0 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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ARL2-SNX15V9GYD0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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