Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD9

UBQLN2, Ubiquilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN2Q9UHD9 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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UBQLN2Q9UHD9 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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