Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM55Q9BYV6 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms