Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms