Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms