Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms