Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC21AQ8NDW8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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