Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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CLDN19Q8N6F1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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CLDN19Q8N6F1 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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CLDN19Q8N6F1 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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CLDN19Q8N6F1 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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CLDN19Q8N6F1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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CLDN19Q8N6F1 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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CLDN19Q8N6F1 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CLDN19Q8N6F1 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CLDN19Q8N6F1 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CLDN19Q8N6F1 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CLDN19Q8N6F1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CLDN19Q8N6F1 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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