Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms