Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RFPL4BQ6ZWI9 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RFPL4BQ6ZWI9 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RFPL4BQ6ZWI9 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RFPL4BQ6ZWI9 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RFPL4BQ6ZWI9 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RFPL4BQ6ZWI9 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RFPL4BQ6ZWI9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RFPL4BQ6ZWI9 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms