Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 SLC33A1-201ENST00000359479 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AL592287.1-201ENST00000637598 2074 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 ABLIM3-211ENST00000517451 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ANKRD39Q53RE8 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms