Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 ASPSCR1-204ENST00000577733 5503 ntTSL 216.39■□□□□ 0.216e-8■■■□□ 18.2
PCBP2Q15366 C2-202ENST00000383177 1847 ntTSL 515.02■□□□□ -02e-48■■■□□ 18.2
PCBP2Q15366 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.272e-48■■■□□ 18.2
PCBP2Q15366 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.32e-48■■■□□ 18.2
PCBP2Q15366 C2-210ENST00000468407 694 ntTSL 210.47□□□□□ -0.732e-48■■■□□ 18.2
PCBP2Q15366 C2-215ENST00000486124 2800 ntTSL 510.38□□□□□ -0.752e-48■■■□□ 18.2
PCBP2Q15366 C2-201ENST00000299367 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.952e-48■■■□□ 18.2
PCBP2Q15366 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.321e-6■■■□□ 18.2
PCBP2Q15366 CHKA-206ENST00000531341 524 ntTSL 319.28■□□□□ 0.681e-6■■■□□ 18.2
PCBP2Q15366 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.251e-6■■■□□ 18.2
PCBP2Q15366 ITFG1-203ENST00000542691 1464 ntTSL 25.19□□□□□ -1.583e-6■■■□□ 18.2
PCBP2Q15366 PHF23-208ENST00000574236 583 ntTSL 321.64■■□□□ 1.057e-7■■■□□ 18.2
PCBP2Q15366 SCFD1-224ENST00000557713 556 ntTSL 414.61□□□□□ -0.071e-6■■■□□ 18.2
PCBP2Q15366 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.191e-6■■■□□ 18.2
PCBP2Q15366 SCFD1-201ENST00000311943 2016 ntTSL 211.38□□□□□ -0.591e-6■■■□□ 18.2
PCBP2Q15366 SCFD1-206ENST00000484733 2308 ntTSL 510.59□□□□□ -0.711e-6■■■□□ 18.2
PCBP2Q15366 SCFD1-215ENST00000555259 1553 ntTSL 1 (best)9.01□□□□□ -0.971e-6■■■□□ 18.2
PCBP2Q15366 SCFD1-202ENST00000396629 2021 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.161e-6■■■□□ 18.2
PCBP2Q15366 SCFD1-222ENST00000556768 1829 ntTSL 1 (best)6.83□□□□□ -1.321e-6■■■□□ 18.2
PCBP2Q15366 SCFD1-210ENST00000553693 490 ntTSL 35.27□□□□□ -1.571e-6■■■□□ 18.2
PCBP2Q15366 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.621e-6■■■□□ 18.2
PCBP2Q15366 SCFD1-223ENST00000557076 743 ntTSL 34.43□□□□□ -1.71e-6■■■□□ 18.2
PCBP2Q15366 SCFD1-204ENST00000463622 1943 ntTSL 23.77□□□□□ -1.811e-6■■■□□ 18.2
PCBP2Q15366 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.421e-6■■■□□ 18.2
PCBP2Q15366 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.23e-8■■■□□ 18.2
PCBP2Q15366 GATAD2B-209ENST00000636014 187 ntTSL 55.21□□□□□ -1.587e-12■■■□□ 18.2
PCBP2Q15366 LRP4-203ENST00000529604 2774 ntTSL 27.91□□□□□ -1.144e-8■■■□□ 18.2
PCBP2Q15366 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.331e-6■■■□□ 18.2
PCBP2Q15366 MDC1-201ENST00000376406 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.732e-7■■■□□ 18.2
PCBP2Q15366 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.021e-323■■■□□ 18.2
PCBP2Q15366 SNHG22-202ENST00000615535 421 nt14.1□□□□□ -0.151e-323■■■□□ 18.2
PCBP2Q15366 AC022384.1-202ENST00000450534 2831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.491e-7■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 AC022384.1-201ENST00000437082 2270 ntAPPRIS P5 TSL 210.73□□□□□ -0.691e-7■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.173e-6■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 H2AFY-211ENST00000507868 861 ntTSL 222.35■■□□□ 1.173e-6■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.963e-6■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.931e-6■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 H2AFY-210ENST00000506671 1905 ntTSL 517.92■□□□□ 0.463e-6■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.093e-6■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 H2AFY-213ENST00000508785 966 ntTSL 215.15■□□□□ 0.023e-6■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 H2AFY-203ENST00000360597 1772 ntTSL 513.65□□□□□ -0.223e-6■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 H2AFY-201ENST00000304332 1881 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.623e-6■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 H2AFY-215ENST00000510038 1314 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.893e-6■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 CTDSP1-213ENST00000496785 460 ntTSL 518.28■□□□□ 0.521e-6■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 CTDSP1-203ENST00000431127 586 ntTSL 316.48■□□□□ 0.231e-6■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 CTDSP1-202ENST00000428361 842 ntTSL 514.35□□□□□ -0.111e-6■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 SELENOW-207ENST00000598956 1032 ntTSL 212.25□□□□□ -0.457e-8■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.343e-7■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 PRPF19-202ENST00000535326 779 ntTSL 512.7□□□□□ -0.383e-7■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 PRPF19-205ENST00000540473 169 ntTSL 56.07□□□□□ -1.443e-7■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 LMBR1-219ENST00000498034 478 ntTSL 318.83■□□□□ 0.62e-6■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 IQSEC1-205ENST00000618604 3744 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.71e-8■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.461e-7■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 SLC38A10-210ENST00000573058 1627 nt24.8■■□□□ 1.561e-16■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.551e-16■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 EPC1-201ENST00000263062 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.622e-6■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 EPC1-202ENST00000319778 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.852e-6■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 EPC1-210ENST00000495790 7386 ntTSL 56.23□□□□□ -1.412e-6■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.812e-6■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 ARAP1-211ENST00000495878 2758 ntTSL 1 (best)12.9□□□□□ -0.342e-6■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 ARAP1-209ENST00000455638 2683 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.422e-6■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.396e-7■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 RIPOR1-209ENST00000564616 745 ntTSL 216.88■□□□□ 0.291e-17■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.754e-7■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.054e-7■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 ETFB-203ENST00000593992 603 ntTSL 214.71□□□□□ -0.054e-7■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 ETFB-205ENST00000596253 575 ntTSL 314.22□□□□□ -0.134e-7■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.311e-9■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 SEH1L-201ENST00000262124 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.511e-9■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 SEH1L-208ENST00000590843 5206 ntTSL 1 (best)10.74□□□□□ -0.691e-9■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 PRKCSH-203ENST00000586486 1613 ntTSL 1 (best)16.41■□□□□ 0.221e-37■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 PRKCSH-213ENST00000591510 591 ntTSL 315.26■□□□□ 0.031e-37■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.43e-6■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.621e-6■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.631e-6■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.641e-6■■■□□ 18.1
PCBP2Q15366 PRRC2A-206ENST00000464890 593 ntTSL 214.51□□□□□ -0.094e-16■■■□□ 18
PCBP2Q15366 EEF1D-237ENST00000531281 813 ntTSL 216.13■□□□□ 0.173e-10■■■□□ 18
PCBP2Q15366 EEF1D-239ENST00000531670 926 ntTSL 314.12□□□□□ -0.153e-10■■■□□ 18
PCBP2Q15366 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.132e-20■■■□□ 18
PCBP2Q15366 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.272e-20■■■□□ 18
PCBP2Q15366 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.032e-20■■■□□ 18
PCBP2Q15366 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.262e-20■■■□□ 18
PCBP2Q15366 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.312e-20■■■□□ 18
PCBP2Q15366 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.083e-7■■■□□ 18
PCBP2Q15366 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.063e-7■■■□□ 18
PCBP2Q15366 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.033e-7■■■□□ 18
PCBP2Q15366 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.013e-7■■■□□ 18
PCBP2Q15366 EPS8L2-208ENST00000526909 3844 ntTSL 512.2□□□□□ -0.463e-7■■■□□ 18
PCBP2Q15366 SLC26A6-211ENST00000431739 588 ntTSL 313.65□□□□□ -0.222e-6■■■□□ 18
PCBP2Q15366 SLC26A6-209ENST00000426599 555 ntTSL 413.27□□□□□ -0.292e-6■■■□□ 18
PCBP2Q15366 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.181e-6■■■□□ 18
PCBP2Q15366 L3MBTL4-208ENST00000583809 549 ntTSL 421.91■■□□□ 1.11e-6■■■□□ 18
PCBP2Q15366 L3MBTL4-206ENST00000581231 568 ntTSL 511.01□□□□□ -0.651e-6■■■□□ 18
PCBP2Q15366 L3MBTL4-202ENST00000400104 4534 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.831e-6■■■□□ 18
PCBP2Q15366 TATDN1-216ENST00000523152 692 ntTSL 518.38■□□□□ 0.533e-7■■■□□ 18
PCBP2Q15366 TATDN1-207ENST00000519776 677 ntTSL 213.85□□□□□ -0.193e-7■■■□□ 18
PCBP2Q15366 TATDN1-219ENST00000523888 591 ntTSL 38.3□□□□□ -1.083e-7■■■□□ 18
PCBP2Q15366 TATDN1-208ENST00000520321 629 ntTSL 58.16□□□□□ -1.13e-7■■■□□ 18
PCBP2Q15366 TATDN1-213ENST00000522310 667 ntTSL 28.03□□□□□ -1.123e-7■■■□□ 18
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 111.7 ms