Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms