Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HBBP68871 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HBBP68871 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms