Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2P22307 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2P22307 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2P22307 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2P22307 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2P22307 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2P22307 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2P22307 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2P22307 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2P22307 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2P22307 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2P22307 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2P22307 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2P22307 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2P22307 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2P22307 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2P22307 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2P22307 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2P22307 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2P22307 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2P22307 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2P22307 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2P22307 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2P22307 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2P22307 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2P22307 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2P22307 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2P22307 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2P22307 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2P22307 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2P22307 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2P22307 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2P22307 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2P22307 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2P22307 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2P22307 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2P22307 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2P22307 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2P22307 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2P22307 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2P22307 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2P22307 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2P22307 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2P22307 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2P22307 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2P22307 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2P22307 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2P22307 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2P22307 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2P22307 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2P22307 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2P22307 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2P22307 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2P22307 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2P22307 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2P22307 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2P22307 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2P22307 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2P22307 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2P22307 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2P22307 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2P22307 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2P22307 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2P22307 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2P22307 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2P22307 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2P22307 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2P22307 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2P22307 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2P22307 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2P22307 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2P22307 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2P22307 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2P22307 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2P22307 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2P22307 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2P22307 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2P22307 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2P22307 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2P22307 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2P22307 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2P22307 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2P22307 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2P22307 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2P22307 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2P22307 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2P22307 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2P22307 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2P22307 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCP2P22307 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCP2P22307 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCP2P22307 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCP2P22307 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCP2P22307 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCP2P22307 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCP2P22307 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCP2P22307 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCP2P22307 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCP2P22307 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCP2P22307 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms