Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms