Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms