Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5S1

TRPV2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV2Q9Y5S1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPV2Q9Y5S1 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms