Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms