Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
L1RE1Q9UN81 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms