Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms