Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLKQ9UBT6 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms