Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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SPOCK3Q9BQ16 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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SPOCK3Q9BQ16 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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SPOCK3Q9BQ16 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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SPOCK3Q9BQ16 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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SPOCK3Q9BQ16 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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SPOCK3Q9BQ16 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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SPOCK3Q9BQ16 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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SPOCK3Q9BQ16 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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SPOCK3Q9BQ16 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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