Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MMP19Q99542 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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