Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX6

LRRC58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC58Q96CX6 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms