Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NCSTNQ92542 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms