Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms