Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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DDB1Q16531 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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DDB1Q16531 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
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DDB1Q16531 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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DDB1Q16531 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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