Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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