Protein–RNA interactions for Protein: Q14657

LAGE3, EKC/KEOPS complex subunit LAGE3, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAGE3Q14657 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LAGE3Q14657 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LAGE3Q14657 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LAGE3Q14657 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LAGE3Q14657 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LAGE3Q14657 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAGE3Q14657 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms