Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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ATP1A4Q13733 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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ATP1A4Q13733 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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ATP1A4Q13733 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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