Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MTMR3Q13615 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms