Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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