Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms