Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYKP34925 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYKP34925 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYKP34925 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYKP34925 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYKP34925 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYKP34925 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYKP34925 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYKP34925 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RYKP34925 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYKP34925 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYKP34925 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYKP34925 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYKP34925 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYKP34925 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYKP34925 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYKP34925 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYKP34925 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RYKP34925 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RYKP34925 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYKP34925 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYKP34925 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RYKP34925 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RYKP34925 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYKP34925 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYKP34925 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RYKP34925 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYKP34925 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYKP34925 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYKP34925 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYKP34925 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYKP34925 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYKP34925 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYKP34925 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYKP34925 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYKP34925 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYKP34925 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYKP34925 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYKP34925 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYKP34925 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYKP34925 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYKP34925 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYKP34925 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYKP34925 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYKP34925 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYKP34925 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYKP34925 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RYKP34925 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYKP34925 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYKP34925 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms