Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms