Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PLNP26678 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PLNP26678 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PLNP26678 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PLNP26678 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PLNP26678 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PLNP26678 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
PLNP26678 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PLNP26678 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PLNP26678 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PLNP26678 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PLNP26678 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PLNP26678 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PLNP26678 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PLNP26678 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms