Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms