Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALUO43852 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALUO43852 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALUO43852 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALUO43852 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALUO43852 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALUO43852 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALUO43852 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALUO43852 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALUO43852 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALUO43852 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALUO43852 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALUO43852 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALUO43852 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALUO43852 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALUO43852 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALUO43852 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALUO43852 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALUO43852 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALUO43852 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALUO43852 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALUO43852 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALUO43852 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALUO43852 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALUO43852 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CALUO43852 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CALUO43852 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALUO43852 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALUO43852 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CALUO43852 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALUO43852 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALUO43852 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALUO43852 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALUO43852 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALUO43852 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALUO43852 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALUO43852 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALUO43852 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALUO43852 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALUO43852 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALUO43852 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CALUO43852 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALUO43852 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALUO43852 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALUO43852 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALUO43852 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALUO43852 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALUO43852 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALUO43852 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CALUO43852 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALUO43852 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALUO43852 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALUO43852 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALUO43852 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALUO43852 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALUO43852 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALUO43852 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALUO43852 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALUO43852 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CALUO43852 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALUO43852 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALUO43852 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALUO43852 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALUO43852 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALUO43852 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALUO43852 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALUO43852 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CALUO43852 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALUO43852 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALUO43852 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CALUO43852 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALUO43852 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CALUO43852 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CALUO43852 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CALUO43852 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CALUO43852 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CALUO43852 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CALUO43852 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALUO43852 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALUO43852 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALUO43852 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALUO43852 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALUO43852 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALUO43852 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALUO43852 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALUO43852 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALUO43852 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALUO43852 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALUO43852 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALUO43852 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALUO43852 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALUO43852 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALUO43852 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALUO43852 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALUO43852 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALUO43852 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALUO43852 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALUO43852 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALUO43852 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALUO43852 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms