Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F8A0AVK6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms