Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6U7

RNF215, RING finger protein 215, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF215Q9Y6U7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF215Q9Y6U7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF215Q9Y6U7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF215Q9Y6U7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF215Q9Y6U7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF215Q9Y6U7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF215Q9Y6U7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF215Q9Y6U7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF215Q9Y6U7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF215Q9Y6U7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF215Q9Y6U7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF215Q9Y6U7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF215Q9Y6U7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF215Q9Y6U7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF215Q9Y6U7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF215Q9Y6U7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF215Q9Y6U7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF215Q9Y6U7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF215Q9Y6U7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF215Q9Y6U7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF215Q9Y6U7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF215Q9Y6U7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF215Q9Y6U7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF215Q9Y6U7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF215Q9Y6U7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF215Q9Y6U7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF215Q9Y6U7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF215Q9Y6U7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF215Q9Y6U7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF215Q9Y6U7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF215Q9Y6U7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF215Q9Y6U7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF215Q9Y6U7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF215Q9Y6U7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF215Q9Y6U7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF215Q9Y6U7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF215Q9Y6U7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF215Q9Y6U7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF215Q9Y6U7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF215Q9Y6U7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF215Q9Y6U7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF215Q9Y6U7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF215Q9Y6U7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF215Q9Y6U7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF215Q9Y6U7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF215Q9Y6U7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF215Q9Y6U7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF215Q9Y6U7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF215Q9Y6U7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF215Q9Y6U7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF215Q9Y6U7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF215Q9Y6U7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF215Q9Y6U7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF215Q9Y6U7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF215Q9Y6U7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms