Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A4Q9Y6R1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A4Q9Y6R1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A4Q9Y6R1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A4Q9Y6R1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A4Q9Y6R1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A4Q9Y6R1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC4A4Q9Y6R1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC4A4Q9Y6R1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC4A4Q9Y6R1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC4A4Q9Y6R1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC4A4Q9Y6R1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC4A4Q9Y6R1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC4A4Q9Y6R1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC4A4Q9Y6R1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC4A4Q9Y6R1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC4A4Q9Y6R1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC4A4Q9Y6R1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC4A4Q9Y6R1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC4A4Q9Y6R1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC4A4Q9Y6R1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC4A4Q9Y6R1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC4A4Q9Y6R1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC4A4Q9Y6R1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC4A4Q9Y6R1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC4A4Q9Y6R1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC4A4Q9Y6R1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC4A4Q9Y6R1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A4Q9Y6R1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A4Q9Y6R1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A4Q9Y6R1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A4Q9Y6R1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A4Q9Y6R1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A4Q9Y6R1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A4Q9Y6R1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A4Q9Y6R1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A4Q9Y6R1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A4Q9Y6R1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A4Q9Y6R1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A4Q9Y6R1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC4A4Q9Y6R1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC4A4Q9Y6R1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC4A4Q9Y6R1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC4A4Q9Y6R1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC4A4Q9Y6R1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC4A4Q9Y6R1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC4A4Q9Y6R1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A4Q9Y6R1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A4Q9Y6R1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A4Q9Y6R1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A4Q9Y6R1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A4Q9Y6R1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A4Q9Y6R1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A4Q9Y6R1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A4Q9Y6R1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC4A4Q9Y6R1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC4A4Q9Y6R1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC4A4Q9Y6R1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC4A4Q9Y6R1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC4A4Q9Y6R1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC4A4Q9Y6R1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC4A4Q9Y6R1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC4A4Q9Y6R1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC4A4Q9Y6R1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC4A4Q9Y6R1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC4A4Q9Y6R1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A4Q9Y6R1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A4Q9Y6R1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A4Q9Y6R1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A4Q9Y6R1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A4Q9Y6R1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A4Q9Y6R1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC4A4Q9Y6R1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC4A4Q9Y6R1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC4A4Q9Y6R1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC4A4Q9Y6R1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC4A4Q9Y6R1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC4A4Q9Y6R1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC4A4Q9Y6R1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC4A4Q9Y6R1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC4A4Q9Y6R1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC4A4Q9Y6R1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC4A4Q9Y6R1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A4Q9Y6R1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A4Q9Y6R1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A4Q9Y6R1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC4A4Q9Y6R1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC4A4Q9Y6R1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC4A4Q9Y6R1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC4A4Q9Y6R1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC4A4Q9Y6R1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms